Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIXQ14938 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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