Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMCO1Q147U7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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