Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP1BQ14684 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRP1BQ14684 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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