Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SQLEQ14534 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SQLEQ14534 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms