Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE4AQ14139 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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