Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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CDH18Q13634 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDH18Q13634 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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