Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms