Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP1R1AQ13522 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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