Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PICALMQ13492 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PICALMQ13492 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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