Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP140Q13342 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP140Q13342 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP140Q13342 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SP140Q13342 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SP140Q13342 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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