Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDZK1IP1Q13113 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDZK1IP1Q13113 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms