Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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