Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFT88Q13099 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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