Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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