Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP160Q12769 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP160Q12769 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUP160Q12769 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUP160Q12769 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NUP160Q12769 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
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