Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSRP1Q08945 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms