Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms