Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms