Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms