Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms