Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms