Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms