Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL8P80075 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL8P80075 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL8P80075 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL8P80075 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL8P80075 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL8P80075 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL8P80075 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms