Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX6P78412 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX6P78412 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX6P78412 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX6P78412 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX6P78412 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX6P78412 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX6P78412 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms