Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms