Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKP1P63208 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKP1P63208 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKP1P63208 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKP1P63208 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms