Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms