Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EEFSECP57772 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms