Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2BFSP57053 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2BFSP57053 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms