Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BACE1P56817 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BACE1P56817 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms