Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms