Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AQP4P55087 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AQP4P55087 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AQP4P55087 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AQP4P55087 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AQP4P55087 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AQP4P55087 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms