Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms