Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms