Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP5P45974 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP5P45974 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP5P45974 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP5P45974 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP5P45974 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP5P45974 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP5P45974 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms