Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2IP36954 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms