Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms