Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD13P35453 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms