Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSG3P32926 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG3P32926 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG3P32926 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms