Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms