Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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HOXD11P31277 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD11P31277 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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HOXD11P31277 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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HOXD11P31277 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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HOXD11P31277 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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HOXD11P31277 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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HOXD11P31277 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC016737.1-201ENST00000605739 1068 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CCT6P3-203ENST00000452026 1383 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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