Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA6P31267 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA6P31267 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms