Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHC1P29353 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHC1P29353 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHC1P29353 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHC1P29353 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms