Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB2P29033 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB2P29033 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB2P29033 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB2P29033 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms