Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD34P28906 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD34P28906 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD34P28906 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms