Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFKBIAP25963 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms