Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KB1P23443 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms