Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GCSHP23434 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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GCSHP23434 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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GCSHP23434 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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