Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCL3P20749 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCL3P20749 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms