Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms